ひとつの生物のすべての転写因子の制御機能の解明

石浜, 明; ISHIHAMA, Akira

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Permalink : https://hdl.handle.net/10114/13413

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ファイル	フォーマット	サイズ	閲覧回数	説明
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論文情報

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アイテムタイプ	研究報告書
タイトル	ひとつの生物のすべての転写因子の制御機能の解明
その他のタイトル	Identification of Regulatory Roles of All Transcription Factors from a Single Organism
著者	e-Rad 研究者番号 80019869 著者名石浜, 明
著者	著者名 ISHIHAMA, Akira
言語	jpn
雑誌名	科学研究費助成事業研究成果報告書
開始ページ	1
終了ページ	6
発行年	2016-05
著者版フラグ	Version of Record
キーワード	転写因子
	RNAポリメラーゼ
	シグマ因子
	ゲノム制御
	転写調節
	大腸菌
	SELEX
内容記述	研究分野：分子生物学
抄録	研究成果の概要 (和文) : 細菌ゲノムに含まれる数千遺伝子から、転写遺伝子の選択と転写レベル決定は、転写酵素RNAポリメラーゼが、２段階での転写調節因子（シグマ因子と転写因子）との相互作用で決定される。大腸菌の7種類シグマ因子と約300種転写因子の全てに関して、独自に開発したSELEX法を利用し、認識し制御する遺伝子セットを同定し、その基盤で、制御標的遺伝子セットを個別に同定した。これは、『ひとつの生物のすべての転写因子の制御機能解明』を同定した、ゲノム新時代最初の画期的成果である。成果は、TEC データベースとして、国立遺伝学研究所から公開した。
抄録	研究成果の概要 (英文) : The genome of the model prokaryote Escherichia coli contains approximately 4,500 genes. Expression pattern of the genome is determined through selective transcription by the RNA polymerase. Its gene selectivity is controlled at two steps through interaction with seven sigma factors and about 300 transcription factors. For identification of regulatory targets by transcription regulators, we identified their binding sites on the E. coli genome using Genomic SELEX system. We have so far identified the regulatory targets for all seven sigma factors and for more then 250 transcription factors. The results altogether are assembled into a single database TEC (Transcription Profile of Escherichia coli) (www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/tec/), which is now open to public through NIG (National Institute of Genetics). Noteworthy is that this is the first success of identification of the regulatory roles of the whole set of transcription regulators form a single organism.
助成	文部科学省科学研究費補助金[基盤研究(C)]　課題番号：25430173　研究期間：2013-2015
資源タイプ	Working Paper
インデックス	資料タイプ別＞科研費報告書
インデックス	401 科研費報告書＞ 2015(平成27)年度科学研究費補助金研究成果報告書