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Permalink : https://hdl.handle.net/10114/8290

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13_kaken_2011_ishihama pdf 690 KB 139

論文情報

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アイテムタイプ
研究報告書
タイトル
大腸菌の全ての転写因子の調節機能とネットワーク全体像の解明
その他のタイトル
Regulatory Roles and Networks of the Whole Set of Transcription Factors in Escherichia coli
著者
e-Rad 研究者番号
80019869 kaken
著者名
石浜, 明
著者名
ISHIHAMA, Akira
言語
jpn
雑誌名
科学研究費助成事業（科学研究費補助金）研究成果報告書
開始ページ
1
終了ページ
6
発行年
2012-05
著者版フラグ
Version of Record
キーワード
ゲノム制御
転写制御
転写因子
大腸菌
内容記述
研究分野：複合新領域。科研費の分科・細目：ゲノム科学・ゲノム調節・基礎ゲノム科学
抄録
研究成果の概要 (和文) : ゲノム転写パターンの決定制御機構の理解を目指し、大腸菌RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子選択能を制御する、転写因子全300種の制御機能の解明を目標とした先端研究を実施し、以下の研究成果を得た。 1) Genomic SELEX法を開発し、転写因子300種のノム上の結合部位を解析し、制御支配下遺伝子群を同定した。 2) NIP-chip法を開発し、菌体内での転写因子作動遺伝子領域を解析した。 3)転写因子遺伝子欠損系統を利用し、転写因子支配下遺伝子群の転写制御を実証した。 4)特異抗体を作製し、転写因子細胞内濃度を決定した。 5)転写因子の制御ネットワーク全体像を提案した。 6)ひとつの生物の全転写因子の制御機能を解明した,最初の成果となった。
研究成果の概要 (英文) : The genome expression is determined by controlling the distribution of a limited number of RNA polymerase within the genome through interaction with transcription factors. The aim of this research was to identify the regulatory role of all 300 transcription factors in the model prokaryote, Escherichia coli. 1) We developed the in vitro Genomic SELEX screening system and determined the regulation target genes for all 300 transcription factors. 2) We also developed the in vivo NIP-chip system and determined the intracellular distribution of transcription factors within the E. coli genome. 3) The regulation targets thus predicted were examined by measuring their expression in the presence and absence of transcription factors. 4) We determined the intracellular levels of all 300 transcription factors by using quantitative immune-blot analysis. 5) Taking all the results together, I have proposed :(1) the list of regulation targets for all 300 transcription factors ; and(2) the interaction network of 300 transcription factors, altogether forming complex hierarchic regulation networks.
助成
文部科学省科学研究費補助金[基盤研究(A)]　課題番号：21241047　研究期間：2009-2011
資源タイプ
Working Paper
インデックス
資料タイプ別 ＞ 科研費報告書
401 科研費報告書 ＞ 2011(平成23)年度 科学研究費補助金研究成果報告書